Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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