Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms