Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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