Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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