Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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