Protein–RNA interactions for Protein: Q13610

PWP1, Periodic tryptophan protein 1 homolog, humanhuman

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PWP1Q13610 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PWP1Q13610 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PWP1Q13610 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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PWP1Q13610 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PWP1Q13610 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PWP1Q13610 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms