Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms