Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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TUBB3Q13509 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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