Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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LSAMPQ13449 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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