Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
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PTPRSQ13332 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PTPRSQ13332 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PTPRSQ13332 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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PTPRSQ13332 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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PTPRSQ13332 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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PTPRSQ13332 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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