Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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