Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms