Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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