Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
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