Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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