Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms