Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
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