Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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TRAF2Q12933 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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TRAF2Q12933 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
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TRAF2Q12933 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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TRAF2Q12933 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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TRAF2Q12933 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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TRAF2Q12933 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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TRAF2Q12933 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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TRAF2Q12933 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
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TRAF2Q12933 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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