Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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