Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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