Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms