Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms