Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms