Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD47Q08722 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD47Q08722 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD47Q08722 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD47Q08722 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD47Q08722 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD47Q08722 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD47Q08722 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD47Q08722 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD47Q08722 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD47Q08722 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CD47Q08722 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD47Q08722 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD47Q08722 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CD47Q08722 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD47Q08722 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD47Q08722 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD47Q08722 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD47Q08722 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD47Q08722 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD47Q08722 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CD47Q08722 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD47Q08722 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD47Q08722 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD47Q08722 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD47Q08722 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD47Q08722 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD47Q08722 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD47Q08722 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD47Q08722 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD47Q08722 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD47Q08722 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD47Q08722 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD47Q08722 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD47Q08722 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CD47Q08722 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD47Q08722 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD47Q08722 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD47Q08722 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD47Q08722 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD47Q08722 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD47Q08722 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD47Q08722 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD47Q08722 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD47Q08722 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD47Q08722 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD47Q08722 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CD47Q08722 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD47Q08722 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD47Q08722 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD47Q08722 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD47Q08722 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD47Q08722 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD47Q08722 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD47Q08722 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD47Q08722 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD47Q08722 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD47Q08722 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD47Q08722 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD47Q08722 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD47Q08722 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD47Q08722 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD47Q08722 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD47Q08722 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD47Q08722 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD47Q08722 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD47Q08722 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD47Q08722 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD47Q08722 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CD47Q08722 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD47Q08722 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD47Q08722 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD47Q08722 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD47Q08722 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD47Q08722 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD47Q08722 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD47Q08722 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD47Q08722 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CD47Q08722 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CD47Q08722 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CD47Q08722 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CD47Q08722 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD47Q08722 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD47Q08722 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD47Q08722 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD47Q08722 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD47Q08722 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD47Q08722 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD47Q08722 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD47Q08722 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD47Q08722 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD47Q08722 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD47Q08722 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD47Q08722 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD47Q08722 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD47Q08722 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD47Q08722 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD47Q08722 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD47Q08722 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD47Q08722 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms