Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
GOLGA3Q08378 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
GOLGA3Q08378 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
GOLGA3Q08378 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GOLGA3Q08378 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GOLGA3Q08378 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GOLGA3Q08378 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GOLGA3Q08378 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GOLGA3Q08378 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GOLGA3Q08378 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GOLGA3Q08378 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GOLGA3Q08378 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GOLGA3Q08378 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GOLGA3Q08378 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GOLGA3Q08378 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GOLGA3Q08378 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GOLGA3Q08378 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GOLGA3Q08378 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GOLGA3Q08378 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GOLGA3Q08378 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GOLGA3Q08378 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GOLGA3Q08378 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GOLGA3Q08378 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GOLGA3Q08378 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GOLGA3Q08378 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GOLGA3Q08378 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GOLGA3Q08378 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GOLGA3Q08378 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GOLGA3Q08378 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GOLGA3Q08378 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GOLGA3Q08378 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GOLGA3Q08378 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GOLGA3Q08378 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA3Q08378 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA3Q08378 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA3Q08378 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA3Q08378 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA3Q08378 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA3Q08378 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA3Q08378 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA3Q08378 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA3Q08378 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA3Q08378 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA3Q08378 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA3Q08378 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA3Q08378 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA3Q08378 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA3Q08378 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA3Q08378 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA3Q08378 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA3Q08378 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA3Q08378 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms