Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms