Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms