Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms