Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms