Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms