Protein–RNA interactions for Protein: P78364

PHC1, Polyhomeotic-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC1P78364 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC1P78364 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC1P78364 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC1P78364 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC1P78364 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC1P78364 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC1P78364 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC1P78364 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC1P78364 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC1P78364 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC1P78364 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC1P78364 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC1P78364 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC1P78364 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC1P78364 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC1P78364 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC1P78364 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC1P78364 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC1P78364 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC1P78364 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC1P78364 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC1P78364 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC1P78364 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC1P78364 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC1P78364 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC1P78364 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC1P78364 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC1P78364 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC1P78364 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC1P78364 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC1P78364 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC1P78364 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC1P78364 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC1P78364 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC1P78364 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC1P78364 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC1P78364 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC1P78364 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC1P78364 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC1P78364 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC1P78364 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC1P78364 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC1P78364 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC1P78364 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC1P78364 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC1P78364 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC1P78364 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC1P78364 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC1P78364 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC1P78364 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC1P78364 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC1P78364 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC1P78364 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC1P78364 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC1P78364 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC1P78364 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC1P78364 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC1P78364 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC1P78364 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC1P78364 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC1P78364 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC1P78364 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHC1P78364 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHC1P78364 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHC1P78364 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHC1P78364 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHC1P78364 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHC1P78364 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHC1P78364 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHC1P78364 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHC1P78364 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHC1P78364 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC1P78364 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC1P78364 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC1P78364 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC1P78364 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC1P78364 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC1P78364 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC1P78364 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC1P78364 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC1P78364 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC1P78364 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC1P78364 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC1P78364 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC1P78364 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC1P78364 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC1P78364 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC1P78364 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC1P78364 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC1P78364 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC1P78364 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC1P78364 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC1P78364 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC1P78364 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC1P78364 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC1P78364 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC1P78364 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC1P78364 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC1P78364 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC1P78364 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms