Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC01547P58512 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms