Protein–RNA interactions for Protein: P57721

PCBP3, Poly(rC)-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP3P57721 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PCBP3P57721 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCBP3P57721 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCBP3P57721 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCBP3P57721 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCBP3P57721 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCBP3P57721 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCBP3P57721 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCBP3P57721 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCBP3P57721 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCBP3P57721 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCBP3P57721 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCBP3P57721 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PCBP3P57721 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PCBP3P57721 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCBP3P57721 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCBP3P57721 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCBP3P57721 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCBP3P57721 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCBP3P57721 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCBP3P57721 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCBP3P57721 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCBP3P57721 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCBP3P57721 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCBP3P57721 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCBP3P57721 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCBP3P57721 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCBP3P57721 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCBP3P57721 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCBP3P57721 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCBP3P57721 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCBP3P57721 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms