Protein–RNA interactions for Protein: P56181

NDUFV3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFV3P56181 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NDUFV3P56181 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NDUFV3P56181 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
NDUFV3P56181 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NDUFV3P56181 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NDUFV3P56181 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NDUFV3P56181 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NDUFV3P56181 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NDUFV3P56181 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NDUFV3P56181 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NDUFV3P56181 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NDUFV3P56181 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NDUFV3P56181 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NDUFV3P56181 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NDUFV3P56181 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NDUFV3P56181 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NDUFV3P56181 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NDUFV3P56181 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NDUFV3P56181 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NDUFV3P56181 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NDUFV3P56181 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NDUFV3P56181 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NDUFV3P56181 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NDUFV3P56181 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NDUFV3P56181 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NDUFV3P56181 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NDUFV3P56181 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NDUFV3P56181 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NDUFV3P56181 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NDUFV3P56181 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NDUFV3P56181 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NDUFV3P56181 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NDUFV3P56181 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NDUFV3P56181 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NDUFV3P56181 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NDUFV3P56181 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NDUFV3P56181 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NDUFV3P56181 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NDUFV3P56181 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NDUFV3P56181 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NDUFV3P56181 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NDUFV3P56181 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NDUFV3P56181 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NDUFV3P56181 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NDUFV3P56181 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NDUFV3P56181 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NDUFV3P56181 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NDUFV3P56181 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms