Protein–RNA interactions for Protein: P50748

KNTC1, Kinetochore-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNTC1P50748 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KNTC1P50748 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms