Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPIAP49247 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPIAP49247 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPIAP49247 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPIAP49247 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPIAP49247 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPIAP49247 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPIAP49247 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPIAP49247 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPIAP49247 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPIAP49247 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPIAP49247 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPIAP49247 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPIAP49247 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPIAP49247 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RPIAP49247 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPIAP49247 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPIAP49247 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPIAP49247 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPIAP49247 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPIAP49247 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPIAP49247 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPIAP49247 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPIAP49247 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPIAP49247 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPIAP49247 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPIAP49247 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPIAP49247 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPIAP49247 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPIAP49247 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPIAP49247 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPIAP49247 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPIAP49247 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RPIAP49247 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPIAP49247 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPIAP49247 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPIAP49247 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPIAP49247 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPIAP49247 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPIAP49247 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPIAP49247 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPIAP49247 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPIAP49247 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPIAP49247 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPIAP49247 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RPIAP49247 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPIAP49247 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPIAP49247 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPIAP49247 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPIAP49247 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPIAP49247 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPIAP49247 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPIAP49247 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RPIAP49247 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPIAP49247 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPIAP49247 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RPIAP49247 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPIAP49247 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPIAP49247 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPIAP49247 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPIAP49247 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPIAP49247 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPIAP49247 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPIAP49247 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPIAP49247 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPIAP49247 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPIAP49247 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPIAP49247 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPIAP49247 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RPIAP49247 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPIAP49247 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPIAP49247 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPIAP49247 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RPIAP49247 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPIAP49247 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RPIAP49247 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPIAP49247 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPIAP49247 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPIAP49247 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPIAP49247 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPIAP49247 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPIAP49247 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPIAP49247 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPIAP49247 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPIAP49247 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPIAP49247 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPIAP49247 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPIAP49247 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPIAP49247 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPIAP49247 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPIAP49247 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPIAP49247 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPIAP49247 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPIAP49247 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPIAP49247 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPIAP49247 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPIAP49247 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RPIAP49247 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPIAP49247 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPIAP49247 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms