Protein–RNA interactions for Protein: P49005

POLD2, DNA polymerase delta subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2P49005 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD2P49005 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD2P49005 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD2P49005 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD2P49005 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD2P49005 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD2P49005 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD2P49005 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD2P49005 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD2P49005 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD2P49005 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD2P49005 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD2P49005 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD2P49005 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD2P49005 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD2P49005 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD2P49005 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD2P49005 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD2P49005 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD2P49005 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD2P49005 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD2P49005 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD2P49005 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD2P49005 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD2P49005 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD2P49005 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD2P49005 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD2P49005 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD2P49005 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD2P49005 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD2P49005 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD2P49005 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD2P49005 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD2P49005 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD2P49005 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD2P49005 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD2P49005 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD2P49005 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD2P49005 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD2P49005 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD2P49005 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD2P49005 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD2P49005 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD2P49005 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD2P49005 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD2P49005 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD2P49005 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD2P49005 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD2P49005 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD2P49005 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD2P49005 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD2P49005 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD2P49005 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD2P49005 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD2P49005 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD2P49005 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD2P49005 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD2P49005 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD2P49005 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD2P49005 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD2P49005 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD2P49005 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD2P49005 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD2P49005 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD2P49005 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD2P49005 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD2P49005 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD2P49005 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD2P49005 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD2P49005 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD2P49005 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD2P49005 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD2P49005 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD2P49005 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD2P49005 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD2P49005 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD2P49005 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD2P49005 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD2P49005 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD2P49005 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD2P49005 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD2P49005 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD2P49005 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD2P49005 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD2P49005 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD2P49005 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD2P49005 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD2P49005 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD2P49005 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD2P49005 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD2P49005 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD2P49005 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD2P49005 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD2P49005 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD2P49005 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD2P49005 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD2P49005 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD2P49005 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD2P49005 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD2P49005 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms