Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRB2P47870 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRB2P47870 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRB2P47870 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRB2P47870 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABRB2P47870 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABRB2P47870 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABRB2P47870 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABRB2P47870 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABRB2P47870 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABRB2P47870 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABRB2P47870 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABRB2P47870 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABRB2P47870 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABRB2P47870 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABRB2P47870 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABRB2P47870 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABRB2P47870 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABRB2P47870 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRB2P47870 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms