Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RECQLP46063 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RECQLP46063 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RECQLP46063 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RECQLP46063 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RECQLP46063 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RECQLP46063 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RECQLP46063 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RECQLP46063 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RECQLP46063 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RECQLP46063 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RECQLP46063 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RECQLP46063 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RECQLP46063 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RECQLP46063 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RECQLP46063 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RECQLP46063 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RECQLP46063 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RECQLP46063 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RECQLP46063 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RECQLP46063 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RECQLP46063 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RECQLP46063 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RECQLP46063 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RECQLP46063 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RECQLP46063 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RECQLP46063 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RECQLP46063 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RECQLP46063 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RECQLP46063 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RECQLP46063 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RECQLP46063 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RECQLP46063 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RECQLP46063 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RECQLP46063 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RECQLP46063 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RECQLP46063 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RECQLP46063 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RECQLP46063 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RECQLP46063 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RECQLP46063 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RECQLP46063 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RECQLP46063 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RECQLP46063 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RECQLP46063 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RECQLP46063 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RECQLP46063 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RECQLP46063 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RECQLP46063 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RECQLP46063 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RECQLP46063 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RECQLP46063 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RECQLP46063 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RECQLP46063 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RECQLP46063 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RECQLP46063 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RECQLP46063 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RECQLP46063 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RECQLP46063 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RECQLP46063 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RECQLP46063 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RECQLP46063 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RECQLP46063 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RECQLP46063 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RECQLP46063 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RECQLP46063 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RECQLP46063 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RECQLP46063 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RECQLP46063 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RECQLP46063 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RECQLP46063 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RECQLP46063 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RECQLP46063 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RECQLP46063 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RECQLP46063 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RECQLP46063 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RECQLP46063 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RECQLP46063 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RECQLP46063 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RECQLP46063 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RECQLP46063 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RECQLP46063 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RECQLP46063 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RECQLP46063 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RECQLP46063 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RECQLP46063 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RECQLP46063 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RECQLP46063 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RECQLP46063 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RECQLP46063 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RECQLP46063 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RECQLP46063 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RECQLP46063 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RECQLP46063 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RECQLP46063 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RECQLP46063 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RECQLP46063 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RECQLP46063 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RECQLP46063 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RECQLP46063 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms