Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms