Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLIP1P30622 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms