Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5DP30049 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms