Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms