Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms