Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms