Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms