Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DESP17661 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DESP17661 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DESP17661 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DESP17661 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DESP17661 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DESP17661 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DESP17661 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DESP17661 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DESP17661 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DESP17661 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DESP17661 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DESP17661 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DESP17661 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DESP17661 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DESP17661 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DESP17661 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DESP17661 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DESP17661 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DESP17661 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DESP17661 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DESP17661 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DESP17661 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DESP17661 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DESP17661 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DESP17661 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DESP17661 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DESP17661 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DESP17661 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DESP17661 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DESP17661 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DESP17661 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DESP17661 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DESP17661 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DESP17661 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DESP17661 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DESP17661 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DESP17661 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DESP17661 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DESP17661 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DESP17661 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DESP17661 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DESP17661 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DESP17661 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DESP17661 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DESP17661 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DESP17661 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DESP17661 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DESP17661 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DESP17661 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DESP17661 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DESP17661 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DESP17661 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DESP17661 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DESP17661 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DESP17661 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DESP17661 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DESP17661 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DESP17661 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DESP17661 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DESP17661 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DESP17661 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DESP17661 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DESP17661 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DESP17661 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DESP17661 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms