Protein–RNA interactions for Protein: P15328

FOLR1, Folate receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOLR1P15328 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms