Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH1P12830 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH1P12830 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH1P12830 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH1P12830 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH1P12830 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH1P12830 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH1P12830 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH1P12830 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH1P12830 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH1P12830 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH1P12830 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH1P12830 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDH1P12830 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDH1P12830 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDH1P12830 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDH1P12830 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDH1P12830 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDH1P12830 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDH1P12830 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH1P12830 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH1P12830 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH1P12830 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH1P12830 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH1P12830 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH1P12830 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH1P12830 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH1P12830 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH1P12830 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH1P12830 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH1P12830 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH1P12830 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH1P12830 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH1P12830 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH1P12830 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH1P12830 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH1P12830 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH1P12830 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH1P12830 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH1P12830 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH1P12830 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH1P12830 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH1P12830 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH1P12830 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH1P12830 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH1P12830 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH1P12830 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH1P12830 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH1P12830 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH1P12830 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH1P12830 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH1P12830 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH1P12830 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH1P12830 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH1P12830 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH1P12830 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH1P12830 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH1P12830 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH1P12830 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH1P12830 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH1P12830 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH1P12830 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH1P12830 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH1P12830 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH1P12830 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH1P12830 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH1P12830 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH1P12830 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH1P12830 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH1P12830 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH1P12830 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH1P12830 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH1P12830 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH1P12830 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH1P12830 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH1P12830 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH1P12830 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH1P12830 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH1P12830 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH1P12830 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH1P12830 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH1P12830 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH1P12830 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH1P12830 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH1P12830 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH1P12830 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH1P12830 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH1P12830 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH1P12830 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH1P12830 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH1P12830 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH1P12830 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH1P12830 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH1P12830 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH1P12830 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH1P12830 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH1P12830 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH1P12830 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH1P12830 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH1P12830 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms