Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EGFRP00533 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EGFRP00533 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EGFRP00533 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EGFRP00533 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EGFRP00533 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EGFRP00533 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
EGFRP00533 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EGFRP00533 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EGFRP00533 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGFRP00533 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGFRP00533 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGFRP00533 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGFRP00533 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGFRP00533 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGFRP00533 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGFRP00533 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGFRP00533 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGFRP00533 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGFRP00533 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGFRP00533 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGFRP00533 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGFRP00533 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGFRP00533 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGFRP00533 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGFRP00533 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGFRP00533 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGFRP00533 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGFRP00533 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGFRP00533 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGFRP00533 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
EGFRP00533 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGFRP00533 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGFRP00533 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGFRP00533 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGFRP00533 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGFRP00533 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGFRP00533 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGFRP00533 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
EGFRP00533 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGFRP00533 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGFRP00533 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGFRP00533 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGFRP00533 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGFRP00533 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGFRP00533 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGFRP00533 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGFRP00533 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGFRP00533 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGFRP00533 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EGFRP00533 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EGFRP00533 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EGFRP00533 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EGFRP00533 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EGFRP00533 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EGFRP00533 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EGFRP00533 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EGFRP00533 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EGFRP00533 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EGFRP00533 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EGFRP00533 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EGFRP00533 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EGFRP00533 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EGFRP00533 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EGFRP00533 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EGFRP00533 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EGFRP00533 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EGFRP00533 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EGFRP00533 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EGFRP00533 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EGFRP00533 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EGFRP00533 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EGFRP00533 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EGFRP00533 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EGFRP00533 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EGFRP00533 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
EGFRP00533 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
EGFRP00533 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGFRP00533 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGFRP00533 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGFRP00533 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGFRP00533 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGFRP00533 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGFRP00533 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGFRP00533 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
EGFRP00533 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGFRP00533 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGFRP00533 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGFRP00533 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGFRP00533 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGFRP00533 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGFRP00533 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGFRP00533 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
EGFRP00533 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGFRP00533 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGFRP00533 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGFRP00533 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGFRP00533 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGFRP00533 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGFRP00533 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.9 ms